ВІМ

Група господаря та мікробів (HMG) – це міждисциплінарна дослідницька група, що спеціалізується на імунній системі, мікробіоті людини та розробці персоналізованої трансляційної медицини на основі індивідуального мультиомічного профілювання пацієнтів. Їхні дослідження включають генетичний та імунологічний аналіз, а також дослідження функціонального мікробіому.

Основна галузь досліджень:

Вісь «господар–дієта–мікробіота–метаболізм–імунна система–нервова система»

Діяльність групи включає імунологічні, генетичні та мікробіомні дослідження, спрямовані на розробку діагностики та терапії для персоналізованої медицини. Команда також зосереджується на впровадженні розробки біоінформатичних методів та інтеграції мультиомних даних за допомогою машинного навчання ( ML ). Метою цієї діяльності є систематичне розуміння складних біологічних взаємодій та їх перетворення в діагностичну та терапевтичну практику, наприклад, у формі комбінаторної імунотерапії , поєднання імунотерапії, клітинної терапії та втручань, спрямованих на дієту та мікробіом.

Одним із методів, що розробляється Групою господаря та мікробів (HMG), є культуроміка – метод екстракорпоральних функціональних досліджень мікробіома, з особливим акцентом на вивченні впливу дієти, пребіотиків, пробіотиків та ліків на мікроорганізми кишечника. Ця робота включає культивування мікроорганізмів, отриманих з мікробіомів людини, для розробки та виділення певних консорціумів мікроорганізмів та постбіотиків з точно визначеними біологічними функціями, що формує основу для мікробіотичної терапії наступного покоління.

Група також проводить фундаментальні наукові дослідження – проекти з розвитку імунної системи немовляти, взаємодії імунної системи та мікробіому, імунної екології, еволюційної імунології, палеобіології та впливу навколишнього середовища (включаючи дієту) на імунний гомеостаз.

ОСІБ

Марцін Пенкальський поєднує імунологію, системну та еволюційну біологію, екологію та омічні технології для вивчення складних взаємодій між дієтою, мікробіомом людини та імунною системою. Його робота включає функціональне профілювання імунної системи на основі омічного методу окремих клітин , аналіз V(D)J-репертуару, профілювання аутоантитіл, імунопептидоміку та дослідження функціонального мікробіому з використанням омічних методів (включаючи метагеноміку, протеоміку та культуроміку) та органоїдів.

Його основна мета — створити персоналізовані програми комбінованої терапії ( комбінаторної імунотерапії ), які поєднують імунотерапію, клітинну терапію та втручання, спрямовані на дієту та мікробіом, як інструменти прецизійної медицини, а також розробити стратегії профілактики аутоімунних та нейрозапальних захворювань у дітей на дуже ранній стадії захворювання у дітей з ризиком розвитку цих станів.

Пьотр Бартоховський зосереджується на дослідженнях функціонального мікробіому, включаючи розробку культуроміки та безперервного культивування , зокрема, для вивчення впливу дієти на мікроорганізми кишечника, зосереджуючись на виділенні штамів, культивуванні та розробці визначених бактеріальних консорціумів зі специфічними біологічними функціями, антимікробній резистентності ( АРР ) для розробки терапії трансплантації фекальної мікробіоти ( ТФМ) наступного покоління.

Його робота зосереджена на розвитку персоналізованої медицини, в якій дієтичні втручання та терапія мікробіому будуть точно адаптовані до індивідуального профілю пацієнта.

Малгожата Межеєвська досліджує сучасні дослідницькі моделі, що обмежують використання тварин, такі як моделі in silico , моделі «органи на чіпі» та органоїди. Ці підходи дозволяють вивчати реакції органів та систем (з акцентом на епігенетичні зміни) на ліки та подразники навколишнього середовища, а також епігенетику, більш етичним та точним чином, підтримуючи розвиток сучасної біомедицини.

Даніель Пиш використовує біоінформатичні інструменти для аналізу мікробіому, вивчаючи взаємодію та метаболічні мережі між мікроорганізмами, що населяють шлунково-кишковий тракт людини. Його робота спрямована на краще розуміння функціонування кишкової екосистеми в контексті персоналізованої медицини.

Команда складається з:

• Д-р Марцін Пенкальський – КЕРІВНИК
• Доктор біологічних наук Пьотр БАРТОХОВСЬКИЙ
• Малгожата МЕЖЕЄВСЬКА, маг. інж.
• Даніель Пиш (обчислювальний біолог)
• д-р Домінік ТРЖУПЕК (консультант з машинного навчання)

Група господаря та мікробів (HMG) – це міждисциплінарна дослідницька група, що спеціалізується на імунній системі, мікробіоті людини та розробці персоналізованої трансляційної медицини на основі індивідуалізованого мультиомічного профілювання пацієнтів, включаючи генетичний аналіз, імунологічний аналіз та дослідження функціонального мікробіому.

Основна область досліджень:
Вісь «господар–дієта–мікробіота–метаболізм–імунна система–нервова система»

Діяльність групи включає імунологічні, генетичні та мікробіомні дослідження, спрямовані на розробку діагностики та терапії для персоналізованої медицини. Команда також зосереджується на впровадженні та розробці біоінформаційних методів та інтеграції мультиомних даних для машинного навчання (МО) з метою досягнення системного розуміння складних біологічних взаємодій та перетворення цих знань у діагностичну та терапевтичну практику, наприклад, у формі комбінаторної імунотерапії, що поєднує імунотерапію, клітинну терапію та втручання, спрямовані на дієту та мікробіом.

Одним із методів, що розробляється в рамках групи Host and Microbe Group (HMG), є культуроміка, метод, який використовується для ex vivo функціональних досліджень мікробіома, з особливим акцентом на дослідженні впливу дієти та пробіотиків на мікроорганізми кишечника. Ця робота включає культивування мікроорганізмів, виділених з мікробіомів людини, а також розробку певних мікробних консорціумів та постбіотиків з точно визначеними біологічними функціями з метою розробки терапії наступного покоління на основі мікробіоти.

Група також проводить фундаментальні дослідження, включаючи проекти з розвитку імунної системи немовлят, взаємодії імунної системи та мікробіому, імуноекології, еволюційної імунології, палеобіології та впливу навколишнього середовища, включаючи дієту, на імунний гомеостаз.

ЛЮДИ

Марцін Пенкальський інтегрує імунологію, системну біологію, еволюційну біологію, екологію та омічні технології для дослідження складних взаємодій між дієтою, мікробіомом людини та імунною системою. У своїй роботі він використовує функціональне імунне профілювання на основі методів оміки окремих клітин, аналіз репертуару V(D)J, профілювання аутоантитіл, імунопептидоміку та дослідження функціонального мікробіому з використанням омічних підходів, культуроміки та органоїдів.

Його головна мета — розробити персоналізовані комбінаторні програми імунотерапії, що поєднують імунотерапію, клітинну терапію, дієту та втручання, спрямовані на мікробіом, як інструменти прецизійної медицини, а також розробити стратегії профілактики аутоімунних та нейрозапальних захворювань у дітей на якомога ранній стадії, особливо у тих, хто має підвищений ризик розвитку цих станів.

Пьотр Бартоховський зосереджується на дослідженнях функціонального мікробіому, включаючи розробку культуроміки, з особливим акцентом на вивченні впливу дієти на мікроорганізми кишечника. Його робота зосереджена на виділенні штамів, культивуванні та розробці визначених бактеріальних консорціумів зі специфічними біологічними функціями, а також на аналізі резистентності до антимікробних препаратів (AMR) з метою розробки терапії трансплантації фекальної мікробіоти (FMT) наступного покоління.

Його дослідження спрямовані на розвиток персоналізованої медицини, в якій дієтичні втручання та терапія мікробіому точно адаптуються до індивідуального профілю пацієнта.

Малгожата Межеєвська працює над передовими дослідницькими моделями, які зменшують використання тварин, такими як моделі in silico , органи на чіпах та органоїди. Ці підходи дозволяють досліджувати реакції органів та біологічних систем на ліки, подразники навколишнього середовища та епігенетичні фактори більш етичним та точним способом, тим самим підтримуючи розвиток сучасної біомедицини.

Даніель Пиш використовує біоінформаційні інструменти для аналізу мікробіому, досліджуючи взаємодії та метаболічні мережі між мікроорганізмами, що населяють шлунково-кишковий тракт людини. Його робота спрямована на краще розуміння функції кишкової екосистеми в контексті персоналізованої медицини.

До складу групи входять:

• Доктор Марцін Пекальський – КЕРІВНИК ГРУПИ
• Доктор біологічних наук Пьотр БАРТОХОВСЬКИЙ
• Малгожата МЕЖЕЄВСЬКА, маг. інж.
• Даніель Пиш (обчислювальний біолог)
• д-р Домінік ТРЖУПЕК (консультант з машинного навчання)